1990年，调入上海中医药大学附属龙华医院任院长。师从名中医言庚孚先生、箫梓荣先生、曾拜全国著名中医，谭日强先生为师，整理谭老学术思想。2003年3月成立龙华医院吴银根中医工作室。2004年9月聘为上海中医药大学吴银根名中医工作室指导老师。目前担任中国中西医结合学会呼吸专业委员会主任委员，上海市中医药学会呼吸分会主任委员，中国中医药学会肺系病学术常务委员。擅长支气管哮喘、慢性支气管炎、支气管扩张、间质性肺炎、慢性咳嗽、肿瘤术后调治、膏方以及中医肺肾系统的调理。握中医辨证之常，略知辨证之变，故中医内科疑难之证亦颇有临证体验。反复学习中医四部经典，对张景岳学术思想心仪已久，主要科研项目均围绕张仲景学术思想和张景岳肾命学说展开。